ГБУ КК «Центр олимпийской подготовки по настольному теннису» был создан в 1999 году, в соответствии с постановлением главы администрации Краснодарского края от 23.03.1999 №194 «О создании государственных учреждений дополнительного образования» с наименованием государственное учреждение дополнительного образования краевая специализированная детско-юношеская школа олимпийского резерва настольного тенниса департамента по физической культуре и спорту администрации края. С 1999 по 2007 год директором организации был Владимир Юльевич Василевский.

В 2007 году учреждение переименовано в государственное образовательное учреждение дополнительного образования детей специализированную детско-юношескую спортивную школу олимпийского резерва настольного тенниса Краснодарского края. 

В 2011 году учреждение переименовано в государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей специализированную детско-юношескую спортивную школу олимпийского резерва настольного тенниса Краснодарского края. С 2007 по 2013 год руководителем был Игорь Валентинович Подносов.

 В 2013 году учреждение переименовано в государственное бюджетное учреждение Краснодарского края «Центр спортивной подготовки по настольному теннису».  

 В 2016 году учреждение переименовано в государственное бюджетное учреждение Краснодарского края «Центр олимпийской подготовки по настольному теннису». С 2013 по 2017 год пост директора занимал Эдуард Робертович Попов.

«Центр олимпийской подготовки по настольному теннису» является юридическим лицом, находящимся в ведении министерства физической культуры и спорта Краснодарского края.

Целью учреждения является обеспечение подготовки спортивных сборных команд Краснодарского края, в режиме круглогодичного процесса тренировок м выполнения индивидуального плана с обеспечением питания, проживания, медицинского и психологического сопровождения и подготовки спортивного резерва для спортивных сборных команд Краснодарского края при реализации программы спортивной подготовки по виду спорта настольный теннис на этапах спортивной подготовки.

Основные виды деятельности учреждения:

1. Реализация программы спортивной подготовки по виду спорта настольный теннис
2. Организация мероприятий по подготовке спортивных сборных команд Краснодарского края.
3. Обеспечение и организация координации деятельности физкультурно-спортивных организаций по подготовке спортивного резерва.
4. Методическое обеспечение организаций, осуществляющих спортивную подготовку.
5. Организация и обеспечение подготовки спортивного резерва для спортивных сборных команд Краснодарского края.
6. Обеспечение координации деятельности по подготовке спортивного резерва для спортивных сборных команд Краснодарского края.
7. Организация и проведение официальных спортивных мероприятий.
8. Участие в организации официальных спортивных мероприятий.
9. Обеспечение участия спортивных сборных команд в официальных спортивных мероприятиях.
10. Реализация программы физической подготовки по виду спорта настольный теннис.

В учреждении выстроена работа по реализации политики организации в области связей с общественностью и отдельных ее этапов:

1. Осуществляется постоянное взаимодействие и поддерживаются контакты с представителями средств массовой информации и общественности.
2. Готовятся пресс-релизы и другие информационные материалы для представителей средств массовой информации, осуществляется мониторинг электронных и печатных средств массовой информации и информационно-аналитических материалов для внутреннего пользования.
3. Разрабатываются информационно-рекламные материалы, тексты для корпоративного издания, официального WEB-ресурса учреждения.

Сейчас в «Центре олимпийской подготовки по настольному теннису» проходят подготовку более 140 спортсменов, из них 85 спортсменов реализуют программу физической подготовки и 59 спортсменов реализуют программу спортивной подготовки по виду спорта «настольный теннис» в соответствии с федеральным стандартом.

За 2019 год 56 спортсменов получили звание - кандидат в мастера спорта России и 48 спортсменов получили звание мастер спорта России.

Ежегодно «Центр олимпийской подготовки» проводит около 20 краевых соревнований.

В учреждении работает 15 тренеров, из них 7 осуществляют подготовку спортсменов для спортивной сборной команды Краснодарского края по настольному теннису. Директором  учреждения с 2017 года по настоящее время является Марина Георгиевна Гордиенко.